Mikoto a des cheveux châtains et porte souvent une petite barrette (d'abord très simple au début de l'histoire, elle est ensuite remplacée par une barrette ornée de deux petites fleurs à partir de l'arc Tree Diagram Remnant, plus précisément dès l'épisode 06 de l'anime Toaru Majutsu no Index II ou le chapitre 058 du manga Toaru Majutsu no Index). Ses yeux sont de la même couleur que ses cheveux. Elle complexe également au sujet de sa poitrine, se sentant inférieure par rapport aux filles dotées d'une poitrine plus généreuse. Elle porte l'uniforme du collège Tokiwadai, composé de chaussettes hautes plissées blanches, de loafers marron, d'un pull sans manches marron clair par-dessus une blouse blanche et d'une jupe grise. Elle est aussi connue pour toujours porter un short sous chacune de ses jupes et robes, ce qui surprend un Kamijou Touma amnésique, celle-ci étant la seule fille à porter un short par-dessus sa culotte.
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